财讯：深圳国家基因库成为全球共享流感数据倡议组织（GISAID）的中国首个正式授权机构

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摘要: cngbdb已成为gisaid在中国的第一个正式授权平台

3月11日，世界卫生组织(世卫组织)宣布，冠状病毒病( covid-19 )具有全球大流行的特征。 3月16日，深圳国家基因库(以下简称国家基因库)与世界共享流感数据倡议组织( gisaid )进行了战术合作。 国家基因库生命大数据平台( cngbdb )成为gisaid在中国的第一个正式认可平台。

成立于2008年的gisaid是目前世界上最大的流感和新型冠状病毒数据平台。 中国在对抗重症急性呼吸综合征( sars )、甲型hin1流感、人类感染h7n9禽流感、covid-19等疫病中发挥了重要意义。 目前，世界各地的研究小组正在共同开展新型冠状病毒相关研究，包括病毒自然史、流行病学、疫苗、诊断试剂、治疗工具等。 此次战术合作将帮助我国科研人员获得一站式病毒数据资源访问服务和更丰富的分析工具，是我国科研机构在合规合法化、保护数据生产者和提交者权利的前提下，促进全球新型冠状病毒和流感数据共享迈出的重要一步

疫情的科学防治需要病毒数据的全球共享

呼吸道感染相关病毒数据的全球共享对于保护人类健康至关重要。 特别是在疫情期间，迅速共享病毒数据，可以为判断疫情风险、启动公共卫生措施、制定医疗措施提供依据。

近年来，全球病毒引发的呼吸道感染频发，其中2009年甲型h1n1流感约15.17万~57.55万人死亡，covid-19持续威胁人类健康。 3月11日，世卫组织宣布covid-19已经具有全球大流行的特征。 截至北京时间3月14日17时，除中国外，135个国家和地区共报告covid-19确诊病例61518例，其中死亡2199例。

截至3月13日，美国国家生物技术新闻中心( ncbi )文献库中收录的各类新型冠状病毒研究副本达800+篇，根据中国临床试验注册中心网站新型冠状病毒肺炎临床研究索引，注册实验达393个项目。

国家基因库与gisaid合作促进病毒数据的全球共享

为了共同支持全球呼吸道感染相关病毒的研究，国家基因库和gisaid达成战术合作，双方围绕呼吸道感染相关病毒的基因数据管理、共享、拆解等方面展开全面合作，促进病毒数据的全球共享。

全球共享流感数据倡议组织( gisaid )倡导的数据共享机制在维护全球公共安全中发挥着重要意义，通过近乎实时的监测，季节性流感、全球大流行性流感和当前的 gisaid的数据来自全球14000名研究者和1500个机构，独特的数据共享机制将推动相关研究的迅速进展，包括对covid-19的认识和相关医疗对策的开发。 gisaid比较新型冠状病毒开发的epicov数据库目前收录了656条新型冠状病毒序列数据(截至3月13日)，超过了以前传输的数据平台。 另外，一直以来流传的数据平台(公共行业的数据库等)被允许匿名访问，因此数据整体的权益得不到保护，数据不透明的问题在gisaid数据共享机构中不存在。

cngbdb-gisaid镜像库

深圳国家基因库( china national genebank，cngb )是我国首个国家级综合性基因库，也是国家重大科技基础设施之一。 年经国家快速发展改革委、财政部、工业和新闻部、卫健委(原卫生部)四部委批准建设，在国家快速发展改革委和深圳市政府为联合理事长单位的理事会指导下，开展了串通遗传资源的保存(生物样本资源库、动植物资源活体库、生物新闻数据库)、、

在生命科学进入大数据时代的背景下，国家基因库生命大数据平台( cngbdb )作为国内最大的生物大数据中心之一，汇集了国家基因库和世界其他重要数据源的公开数据，是可靠的共享计算机 在此次新型冠状病毒疫情中，cngbdb平台汇总了国家基因库归档和ncbi病毒序列数据资源159条(截至3月13日)，帮助研究者快速发现、检索、拆解病毒。

cngbdb作为gisaid正式授权平台，继承gisaid数据共享理念，维护数据生产者和数据提交者的权利，为国内科技成果发布搭建便利通道，与gisaid共同构建全球病毒基因组序列和相关情况资源可靠共享机制。

基于新数据服务体验的呼吸道感染研究

一站式获取最全面的数据新闻

cngbdb包含gisaid、ncbi和cngb病毒数据，提供同步更新的一站式数据访问服务。 从今天开始，客户可以登录cngbdb病毒数据库，查看/下载新的冠状病毒数据新闻。

方便的gisaid访问

cngbdb将安装gisaid镜像站，以中国英语两种语言为国内客户提供方便的gisaid访问通道，全面提高访问和数据下载速度。

实时数据观察

cngbdb基于gisaid采用的nextstrain (实时可视化工具)，开发了多个比较新型冠状病毒基因组的安全联合计算工具，推进了病毒基因组的数据共享，跟踪了病毒的进化，监视了新型的突变。

国家基因库是长期致力于建立生命资源的全球合作互联网，此次与gisaid的合作，将进一步推动全球生命大数据资源可靠共享机制的建设，为各国共同应对全球健康挑战。 (资料来源:北国网)

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